Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EBF1Q9UH73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF1Q9UH73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF1Q9UH73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EBF1Q9UH73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBF1Q9UH73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF1Q9UH73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF1Q9UH73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF1Q9UH73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms