Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF9Q9P2J2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF9Q9P2J2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IGSF9Q9P2J2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGSF9Q9P2J2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF9Q9P2J2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGSF9Q9P2J2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGSF9Q9P2J2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF9Q9P2J2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms