Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPSF2Q9P2I0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPSF2Q9P2I0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPSF2Q9P2I0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPSF2Q9P2I0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF2Q9P2I0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF2Q9P2I0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPSF2Q9P2I0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms