Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHMP5Q9NZZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHMP5Q9NZZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHMP5Q9NZZ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHMP5Q9NZZ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CHMP5Q9NZZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHMP5Q9NZZ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHMP5Q9NZZ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHMP5Q9NZZ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHMP5Q9NZZ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHMP5Q9NZZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHMP5Q9NZZ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHMP5Q9NZZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHMP5Q9NZZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHMP5Q9NZZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHMP5Q9NZZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 947.5 ms