Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ITSN2Q9NZM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ITSN2Q9NZM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ITSN2Q9NZM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ITSN2Q9NZM3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ITSN2Q9NZM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ITSN2Q9NZM3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ITSN2Q9NZM3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ITSN2Q9NZM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ITSN2Q9NZM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ITSN2Q9NZM3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ITSN2Q9NZM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
ITSN2Q9NZM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ITSN2Q9NZM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ITSN2Q9NZM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ITSN2Q9NZM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ITSN2Q9NZM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ITSN2Q9NZM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ITSN2Q9NZM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ITSN2Q9NZM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ITSN2Q9NZM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ITSN2Q9NZM3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms