Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMOD3Q9NYL9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMOD3Q9NYL9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TMOD3Q9NYL9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TMOD3Q9NYL9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TMOD3Q9NYL9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TMOD3Q9NYL9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TMOD3Q9NYL9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TMOD3Q9NYL9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TMOD3Q9NYL9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TMOD3Q9NYL9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TMOD3Q9NYL9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TMOD3Q9NYL9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TMOD3Q9NYL9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms