Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.25■■■■■ 4.83
TMOD3Q9NYL9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
TMOD3Q9NYL9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TMOD3Q9NYL9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TMOD3Q9NYL9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TMOD3Q9NYL9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TMOD3Q9NYL9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TMOD3Q9NYL9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
TMOD3Q9NYL9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TMOD3Q9NYL9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TMOD3Q9NYL9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TMOD3Q9NYL9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TMOD3Q9NYL9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TMOD3Q9NYL9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TMOD3Q9NYL9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TMOD3Q9NYL9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TMOD3Q9NYL9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TMOD3Q9NYL9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TMOD3Q9NYL9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TMOD3Q9NYL9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TMOD3Q9NYL9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TMOD3Q9NYL9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TMOD3Q9NYL9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TMOD3Q9NYL9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TMOD3Q9NYL9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TMOD3Q9NYL9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TMOD3Q9NYL9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TMOD3Q9NYL9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TMOD3Q9NYL9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TMOD3Q9NYL9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TMOD3Q9NYL9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TMOD3Q9NYL9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TMOD3Q9NYL9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TMOD3Q9NYL9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
TMOD3Q9NYL9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
TMOD3Q9NYL9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
TMOD3Q9NYL9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
TMOD3Q9NYL9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TMOD3Q9NYL9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TMOD3Q9NYL9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TMOD3Q9NYL9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TMOD3Q9NYL9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TMOD3Q9NYL9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TMOD3Q9NYL9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TMOD3Q9NYL9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TMOD3Q9NYL9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TMOD3Q9NYL9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TMOD3Q9NYL9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TMOD3Q9NYL9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TMOD3Q9NYL9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
TMOD3Q9NYL9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TMOD3Q9NYL9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TMOD3Q9NYL9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TMOD3Q9NYL9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TMOD3Q9NYL9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TMOD3Q9NYL9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TMOD3Q9NYL9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TMOD3Q9NYL9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TMOD3Q9NYL9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TMOD3Q9NYL9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TMOD3Q9NYL9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TMOD3Q9NYL9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TMOD3Q9NYL9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TMOD3Q9NYL9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TMOD3Q9NYL9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TMOD3Q9NYL9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
TMOD3Q9NYL9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TMOD3Q9NYL9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TMOD3Q9NYL9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TMOD3Q9NYL9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TMOD3Q9NYL9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TMOD3Q9NYL9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TMOD3Q9NYL9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TMOD3Q9NYL9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TMOD3Q9NYL9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TMOD3Q9NYL9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TMOD3Q9NYL9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TMOD3Q9NYL9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TMOD3Q9NYL9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TMOD3Q9NYL9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TMOD3Q9NYL9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TMOD3Q9NYL9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TMOD3Q9NYL9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TMOD3Q9NYL9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TMOD3Q9NYL9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
TMOD3Q9NYL9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TMOD3Q9NYL9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TMOD3Q9NYL9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TMOD3Q9NYL9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TMOD3Q9NYL9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
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