Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C1orf109Q9NX04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf109Q9NX04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf109Q9NX04 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf109Q9NX04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf109Q9NX04 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf109Q9NX04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf109Q9NX04 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf109Q9NX04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf109Q9NX04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms