Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3BQ9NW08 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR3BQ9NW08 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR3BQ9NW08 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR3BQ9NW08 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR3BQ9NW08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3BQ9NW08 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3BQ9NW08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR3BQ9NW08 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR3BQ9NW08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms