Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A9Q9NUM3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A9Q9NUM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A9Q9NUM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A9Q9NUM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A9Q9NUM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms