Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ5

SACM1L, Phosphatidylinositide phosphatase SAC1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACM1LQ9NTJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SACM1LQ9NTJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SACM1LQ9NTJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SACM1LQ9NTJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SACM1LQ9NTJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SACM1LQ9NTJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SACM1LQ9NTJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SACM1LQ9NTJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SACM1LQ9NTJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SACM1LQ9NTJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SACM1LQ9NTJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SACM1LQ9NTJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SACM1LQ9NTJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms