Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1GALT1Q9NS00 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1GALT1Q9NS00 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1GALT1Q9NS00 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1GALT1Q9NS00 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1GALT1Q9NS00 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1GALT1Q9NS00 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C1GALT1Q9NS00 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1GALT1Q9NS00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1GALT1Q9NS00 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1GALT1Q9NS00 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1GALT1Q9NS00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1GALT1Q9NS00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms