Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBM6

TAF9B, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9BQ9HBM6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9BQ9HBM6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF9BQ9HBM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF9BQ9HBM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF9BQ9HBM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF9BQ9HBM6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF9BQ9HBM6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF9BQ9HBM6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF9BQ9HBM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms