Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO4Q9GZR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
REXO4Q9GZR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
REXO4Q9GZR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REXO4Q9GZR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
REXO4Q9GZR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
REXO4Q9GZR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REXO4Q9GZR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REXO4Q9GZR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO4Q9GZR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms