Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN7

ROGDI, Protein rogdi homolog, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDIQ9GZN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROGDIQ9GZN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROGDIQ9GZN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROGDIQ9GZN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ROGDIQ9GZN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROGDIQ9GZN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ROGDIQ9GZN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ROGDIQ9GZN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ROGDIQ9GZN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROGDIQ9GZN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ROGDIQ9GZN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROGDIQ9GZN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROGDIQ9GZN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROGDIQ9GZN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROGDIQ9GZN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms