Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASXL3Q9C0F0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASXL3Q9C0F0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASXL3Q9C0F0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASXL3Q9C0F0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASXL3Q9C0F0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASXL3Q9C0F0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ASXL3Q9C0F0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASXL3Q9C0F0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ASXL3Q9C0F0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASXL3Q9C0F0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASXL3Q9C0F0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASXL3Q9C0F0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms