Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM6Q9C030 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM6Q9C030 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM6Q9C030 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM6Q9C030 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM6Q9C030 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM6Q9C030 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRIM6Q9C030 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM6Q9C030 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms