Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPCDR1Q9BY65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPCDR1Q9BY65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPCDR1Q9BY65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPCDR1Q9BY65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPCDR1Q9BY65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPCDR1Q9BY65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPCDR1Q9BY65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPCDR1Q9BY65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPCDR1Q9BY65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPCDR1Q9BY65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPCDR1Q9BY65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPCDR1Q9BY65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms