Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SALL3Q9BXA9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SALL3Q9BXA9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SALL3Q9BXA9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SALL3Q9BXA9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SALL3Q9BXA9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SALL3Q9BXA9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SALL3Q9BXA9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SALL3Q9BXA9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SALL3Q9BXA9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SALL3Q9BXA9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SALL3Q9BXA9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL3Q9BXA9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL3Q9BXA9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL3Q9BXA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL3Q9BXA9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms