Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAIPQ9BWF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAIPQ9BWF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAIPQ9BWF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAIPQ9BWF2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRAIPQ9BWF2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAIPQ9BWF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAIPQ9BWF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAIPQ9BWF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAIPQ9BWF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAIPQ9BWF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAIPQ9BWF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAIPQ9BWF2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms