Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRI1Q9BV20 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRI1Q9BV20 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRI1Q9BV20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRI1Q9BV20 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRI1Q9BV20 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRI1Q9BV20 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRI1Q9BV20 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRI1Q9BV20 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms