Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRDL1Q9BU40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRDL1Q9BU40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRDL1Q9BU40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRDL1Q9BU40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRDL1Q9BU40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRDL1Q9BU40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRDL1Q9BU40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRDL1Q9BU40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRDL1Q9BU40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRDL1Q9BU40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms