Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX7Q9BT81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX7Q9BT81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX7Q9BT81 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX7Q9BT81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOX7Q9BT81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX7Q9BT81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX7Q9BT81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX7Q9BT81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms