Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NDFIP1Q9BT67 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDFIP1Q9BT67 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDFIP1Q9BT67 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDFIP1Q9BT67 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDFIP1Q9BT67 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDFIP1Q9BT67 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDFIP1Q9BT67 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms