Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRADC1Q9BSG0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRADC1Q9BSG0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRADC1Q9BSG0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRADC1Q9BSG0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRADC1Q9BSG0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRADC1Q9BSG0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRADC1Q9BSG0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRADC1Q9BSG0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRADC1Q9BSG0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRADC1Q9BSG0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms