Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRIP2Q9BQI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP2Q9BQI9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP2Q9BQI9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP2Q9BQI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP2Q9BQI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP2Q9BQI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP2Q9BQI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRIP2Q9BQI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRIP2Q9BQI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms