Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ELF4Q99607 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ELF4Q99607 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ELF4Q99607 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ELF4Q99607 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ELF4Q99607 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ELF4Q99607 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ELF4Q99607 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ELF4Q99607 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ELF4Q99607 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms