Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOTCH4Q99466 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOTCH4Q99466 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NOTCH4Q99466 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOTCH4Q99466 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOTCH4Q99466 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOTCH4Q99466 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NOTCH4Q99466 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOTCH4Q99466 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms