Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP89Q96ST8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP89Q96ST8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CEP89Q96ST8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CEP89Q96ST8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP89Q96ST8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP89Q96ST8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP89Q96ST8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP89Q96ST8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP89Q96ST8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms