Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST1H2AAQ96QV6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST1H2AAQ96QV6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIST1H2AAQ96QV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST1H2AAQ96QV6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST1H2AAQ96QV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H2AAQ96QV6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H2AAQ96QV6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms