Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms