Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAPZA3Q96KX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPZA3Q96KX2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPZA3Q96KX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPZA3Q96KX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPZA3Q96KX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPZA3Q96KX2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPZA3Q96KX2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPZA3Q96KX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms