Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CAPZA3Q96KX2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CAPZA3Q96KX2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAPZA3Q96KX2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CAPZA3Q96KX2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAPZA3Q96KX2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAPZA3Q96KX2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAPZA3Q96KX2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CAPZA3Q96KX2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAPZA3Q96KX2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAPZA3Q96KX2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAPZA3Q96KX2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CAPZA3Q96KX2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CAPZA3Q96KX2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CAPZA3Q96KX2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CAPZA3Q96KX2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAPZA3Q96KX2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAPZA3Q96KX2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAPZA3Q96KX2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPZA3Q96KX2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAPZA3Q96KX2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAPZA3Q96KX2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAPZA3Q96KX2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAPZA3Q96KX2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPZA3Q96KX2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPZA3Q96KX2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPZA3Q96KX2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CAPZA3Q96KX2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CAPZA3Q96KX2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CAPZA3Q96KX2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPZA3Q96KX2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CAPZA3Q96KX2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAPZA3Q96KX2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CAPZA3Q96KX2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CAPZA3Q96KX2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CAPZA3Q96KX2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAPZA3Q96KX2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAPZA3Q96KX2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CAPZA3Q96KX2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAPZA3Q96KX2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAPZA3Q96KX2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CAPZA3Q96KX2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CAPZA3Q96KX2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CAPZA3Q96KX2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CAPZA3Q96KX2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CAPZA3Q96KX2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CAPZA3Q96KX2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CAPZA3Q96KX2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CAPZA3Q96KX2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CAPZA3Q96KX2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CAPZA3Q96KX2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CAPZA3Q96KX2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CAPZA3Q96KX2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAPZA3Q96KX2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAPZA3Q96KX2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAPZA3Q96KX2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CAPZA3Q96KX2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CAPZA3Q96KX2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CAPZA3Q96KX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CAPZA3Q96KX2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAPZA3Q96KX2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CAPZA3Q96KX2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CAPZA3Q96KX2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAPZA3Q96KX2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAPZA3Q96KX2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAPZA3Q96KX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAPZA3Q96KX2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAPZA3Q96KX2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAPZA3Q96KX2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAPZA3Q96KX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAPZA3Q96KX2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CAPZA3Q96KX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPZA3Q96KX2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPZA3Q96KX2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPZA3Q96KX2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPZA3Q96KX2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAPZA3Q96KX2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAPZA3Q96KX2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAPZA3Q96KX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CAPZA3Q96KX2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAPZA3Q96KX2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CAPZA3Q96KX2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CAPZA3Q96KX2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAPZA3Q96KX2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms