Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN17Q96FV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN17Q96FV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN17Q96FV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN17Q96FV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN17Q96FV3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN17Q96FV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSPAN17Q96FV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN17Q96FV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN17Q96FV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN17Q96FV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms