Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIB2Q96AX9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MIB2Q96AX9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIB2Q96AX9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MIB2Q96AX9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MIB2Q96AX9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIB2Q96AX9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MIB2Q96AX9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms