Protein–RNA interactions for Protein: Q96AD5

PNPLA2, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA2Q96AD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNPLA2Q96AD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA2Q96AD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA2Q96AD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA2Q96AD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA2Q96AD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA2Q96AD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA2Q96AD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA2Q96AD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms