Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM171Q8WVE6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM171Q8WVE6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM171Q8WVE6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM171Q8WVE6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM171Q8WVE6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM171Q8WVE6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms