Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMO3Q8TAP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMO3Q8TAP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMO3Q8TAP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMO3Q8TAP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMO3Q8TAP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMO3Q8TAP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMO3Q8TAP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMO3Q8TAP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMO3Q8TAP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMO3Q8TAP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO3Q8TAP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMO3Q8TAP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMO3Q8TAP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMO3Q8TAP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO3Q8TAP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO3Q8TAP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms