Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCL2Q8N4E4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCL2Q8N4E4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCL2Q8N4E4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDCL2Q8N4E4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDCL2Q8N4E4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCL2Q8N4E4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL2Q8N4E4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCL2Q8N4E4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL2Q8N4E4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms