Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFRP1Q8N474 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFRP1Q8N474 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFRP1Q8N474 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFRP1Q8N474 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SFRP1Q8N474 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFRP1Q8N474 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFRP1Q8N474 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFRP1Q8N474 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1744.3 ms