Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TREML1Q86YW5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TREML1Q86YW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TREML1Q86YW5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TREML1Q86YW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TREML1Q86YW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TREML1Q86YW5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TREML1Q86YW5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TREML1Q86YW5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TREML1Q86YW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms