Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSRQ86X29 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSRQ86X29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSRQ86X29 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSRQ86X29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LSRQ86X29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSRQ86X29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LSRQ86X29 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSRQ86X29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms