Protein–RNA interactions for Protein: Q7L273

KCTD9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD9Q7L273 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCTD9Q7L273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD9Q7L273 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD9Q7L273 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCTD9Q7L273 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCTD9Q7L273 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCTD9Q7L273 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD9Q7L273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD9Q7L273 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.1 ms