Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400NLQ6ZTU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400NLQ6ZTU2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400NLQ6ZTU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400NLQ6ZTU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400NLQ6ZTU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400NLQ6ZTU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EP400NLQ6ZTU2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EP400NLQ6ZTU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EP400NLQ6ZTU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EP400NLQ6ZTU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EP400NLQ6ZTU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EP400NLQ6ZTU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EP400NLQ6ZTU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400NLQ6ZTU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms