Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EP400NLQ6ZTU2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
EP400NLQ6ZTU2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
EP400NLQ6ZTU2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
EP400NLQ6ZTU2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EP400NLQ6ZTU2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
EP400NLQ6ZTU2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
EP400NLQ6ZTU2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EP400NLQ6ZTU2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
EP400NLQ6ZTU2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EP400NLQ6ZTU2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
EP400NLQ6ZTU2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
EP400NLQ6ZTU2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400NLQ6ZTU2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EP400NLQ6ZTU2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EP400NLQ6ZTU2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EP400NLQ6ZTU2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
EP400NLQ6ZTU2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
EP400NLQ6ZTU2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
EP400NLQ6ZTU2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EP400NLQ6ZTU2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EP400NLQ6ZTU2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EP400NLQ6ZTU2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EP400NLQ6ZTU2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EP400NLQ6ZTU2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400NLQ6ZTU2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
EP400NLQ6ZTU2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EP400NLQ6ZTU2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EP400NLQ6ZTU2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400NLQ6ZTU2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EP400NLQ6ZTU2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
EP400NLQ6ZTU2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EP400NLQ6ZTU2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EP400NLQ6ZTU2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EP400NLQ6ZTU2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
EP400NLQ6ZTU2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EP400NLQ6ZTU2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
EP400NLQ6ZTU2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
EP400NLQ6ZTU2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
EP400NLQ6ZTU2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EP400NLQ6ZTU2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EP400NLQ6ZTU2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EP400NLQ6ZTU2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
EP400NLQ6ZTU2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EP400NLQ6ZTU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400NLQ6ZTU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400NLQ6ZTU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EP400NLQ6ZTU2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EP400NLQ6ZTU2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400NLQ6ZTU2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400NLQ6ZTU2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400NLQ6ZTU2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EP400NLQ6ZTU2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EP400NLQ6ZTU2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400NLQ6ZTU2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400NLQ6ZTU2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EP400NLQ6ZTU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400NLQ6ZTU2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400NLQ6ZTU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EP400NLQ6ZTU2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EP400NLQ6ZTU2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EP400NLQ6ZTU2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
EP400NLQ6ZTU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EP400NLQ6ZTU2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
EP400NLQ6ZTU2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EP400NLQ6ZTU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EP400NLQ6ZTU2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EP400NLQ6ZTU2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EP400NLQ6ZTU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EP400NLQ6ZTU2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EP400NLQ6ZTU2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EP400NLQ6ZTU2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
EP400NLQ6ZTU2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EP400NLQ6ZTU2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EP400NLQ6ZTU2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EP400NLQ6ZTU2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EP400NLQ6ZTU2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EP400NLQ6ZTU2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EP400NLQ6ZTU2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EP400NLQ6ZTU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EP400NLQ6ZTU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EP400NLQ6ZTU2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
EP400NLQ6ZTU2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EP400NLQ6ZTU2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms