Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4orf50Q6ZRC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4orf50Q6ZRC1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C4orf50Q6ZRC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C4orf50Q6ZRC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4orf50Q6ZRC1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C4orf50Q6ZRC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4orf50Q6ZRC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C4orf50Q6ZRC1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4orf50Q6ZRC1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4orf50Q6ZRC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4orf50Q6ZRC1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4orf50Q6ZRC1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4orf50Q6ZRC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms