Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD276Q5ZPR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD276Q5ZPR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD276Q5ZPR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD276Q5ZPR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD276Q5ZPR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD276Q5ZPR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD276Q5ZPR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms