Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CROCCQ5TZA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CROCCQ5TZA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CROCCQ5TZA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CROCCQ5TZA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CROCCQ5TZA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CROCCQ5TZA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CROCCQ5TZA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CROCCQ5TZA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CROCCQ5TZA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CROCCQ5TZA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms