Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A1-AS1Q5TC04 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A1-AS1Q5TC04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A1-AS1Q5TC04 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A1-AS1Q5TC04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms