Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP58Q5T655 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP58Q5T655 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP58Q5T655 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP58Q5T655 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP58Q5T655 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP58Q5T655 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP58Q5T655 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP58Q5T655 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms